Madarasah Aliyah Negeri (MAN) 4 Model Jakarta didirikan pada tanggal 29 April tahun 1992. Dan pada tahun 1998  Madarasah Aliyah Negeri 4 Jakarta Atas berbagai prestasi yang di raihnya di tetapkan sebagai MAN 4 Model untuk DKI Jakarta oleh menteri Agama RI . Sesuai Surat Keputusan Dirjen Binbaga Islam NO. E.IV/PP.00.6/Kep/17.a/1998 Tanggal 20 Febuari 1998.

Sebagai MAN Model satu-satunya di DKI Jakarta, MAN 4 berkomitmen untuk terus menerus dan berkesinambungan meningkatkan mutu dalam berbagai aspek,  baik manajemen, kurikulum, dan pembelajaran, kualitas siswa, sarana prasarana dan lain sebagainya. Bukti komitmen terhadap mutu ini, MAN 4 Model Jakarata pada Nopember 2007 berhasil meraih sertifikat Internasional dalam penerapan Sistem Manajemen Mutu ISO 9001:2000, dan telah ditetapkan oleh Dirjen pendidikan pada madrasah Depag. RI. menjadi madrasah rintisan menuju Madrasah Bertaraf Internasional (MBI).